根据沙依巴克区建设局（交通局、水务局、人民防空办公室）机构职责，沙区建设局设1个内设机构，9个事业单位。

一、局办公室。主要负责文秘、行政、党务、组织、纪检、宣传、人事、档案、保密、综合协调、后勤保障等工作。负责制定各项工作制度并监督落实；负责上传下达，拟定全局工作计划、各项工作阶段性汇报及年终总结；负责安全生产、应急管理等工作；负责宣传党的各项方针政策；负责党的基层组织建设和党员队伍建设工作；负责党风廉政建设工作；负责工会、妇联等群团组织日常工作。

二、区水务监察大队。贯彻执行有关水务方面的法律、法规、规章；负责权限内水域、水务工程、水土保持生态环境和防汛抗旱等有关设施的保护；监督检查权限内的水事活动，维护正常的水事秩序；对要权限内公民、法人或其他组织违反水务管理相关法律、法规、规章的行为进行查处；配合、协助公安和司法部门查处水事治安和刑事案件。

三、区交通管理服务中心。负责辖区内一般农村公路的建设；承担辖区内三级以下（含三级）客运站及乡级客运站的建设；公交线路枢纽场站及公交首末站（停车场）的建设；公交港湾式站点和一般站点的建设。辖区内飞机场、公路客运站出租汽车营运营运秩序的管理。

四、区物业监督管理办公室。贯彻执行国家和地方有关物业管理方面的法律、法规及规定；负责三级物业服务企业资质证书的颁发和管理工作；物业服务合同的备案；受理相关投诉，协调处理物业管理活动中的矛盾纠纷；组织实施辖区无物业管理老旧小区共用设备设施的改造工作；指导、监督、检查辖区物业承接查验活动；负责业主大会和业主委员会日常活动和监督工作。

五、区建设综合管理服务中心。负责本级人民政府有关部门审批、核准、备案的建设项目及其他非政府投资5000万元以下的应当招标的建设项目的勘察、设计、施工、监理和附属设施、材料采购的招标投标监督工作；沙区范围内城市次干道、支路、巷道及附属设施以及七层以下（含七层）且总建筑面积3万平米以下（含3万平米）以内的群体住宅小区的施工许可的办理；施工许可证发放范围内对施工合同、造价咨询合同、招标控制价、竣工结算的备案管理；施工许可证发放范围内劳保统筹费、城市基础设施配套费、城市供热配套费、墙改基金、散装水泥基金的征收。

六、区住房保障管理中心。贯彻执行国家、自治区、乌鲁木齐市关于住房保障管理的各项政策、做好本辖区内经济适用房、廉租房、解危解困房等住房保障管理的具体工作。负责申请经济适用房、廉租房、公共租赁住房资格的初审。

七、区建设工程质量安全监督站。负责辖区内建筑节能改造的管理；建筑工地围挡检查及扬尘防治管理；负责辖区内施工许可证发放范围内建设工程安全生产、工程质量、程地震安全性评价的监督管理。

八、区河湖管理中心。贯彻执行有关河湖方面的法律、法规、规章；负责权限内河湖有关设施的保护；监督检查权限内的水事活动，维护正常的水事秩序；对要权限内公民、法人或其他组织违反水务管理相关法律、法规、规章的行为进行查处；配合、协助公安和司法部门查处水事治安和刑事案件。

九、区雅玛里克山污水处理厂。收集，处理城市污水，为雅玛里克山绿化提供灌溉水源，促进生态环境改善。

十、九家湾水库管理站。负责水库的日常运转、管理、维护、开发及相关防洪、灌溉工作；管理水库工程和库区设施。